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May 03, 2023

Acquisizione e trasporto di multi geneticamente diversi

Communications Medicine

Medicina delle comunicazioni volume 3, numero articolo: 79 (2023) Citare questo articolo

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Questo studio genomico dettagliato ha caratterizzato la presenza di bacilli Gram negativi multiresistenti (MDR-GNB) nei neonati < 2 kg e nelle madri accoppiate in un ospedale africano con poche risorse.

Questo studio di coorte trasversale è stato condotto presso l'unità di riferimento neonatale in Gambia con campionamento cutaneo e perianale neonatale settimanale e tamponi retto-vaginali materni accoppiati. La potenziale coltura batteriologica ha utilizzato l'agar MacConkey con identificazione delle specie mediante API20E e API20NE. Tutti gli isolati GNB sono stati sottoposti a sequenziamento dell'intero genoma sulla piattaforma Illumina Miseq. La tipizzazione di sequenze multi-locus e l'analisi della distanza SNP hanno identificato il tipo di ceppo e la sua correlazione.

135 tamponi provenienti da 34 neonati e 21 madri accoppiate hanno prodotto 137 isolati GNB, di cui 112 sono assemblaggi de novo di alta qualità. La prevalenza neonatale di portatore di MDR-GNB è del 41% (14/34) al momento del ricovero, con l'85% (11/13) di nuove acquisizioni entro 7 giorni. Molteplici specie MDR ed ESBL-GNB vengono trasportate in punti temporali diversi, più frequentemente K. pneumoniae ed E. coli, con diversità di ceppi eterogenei e nessuna evidenza di clonalità. 111 distinti geni di resistenza agli antibiotici sono principalmente beta lattamasi (Bla-AMPH, Bla-PBP, CTX-M-15, Bla-TEM-105). Il 76% (16/21) e il 62% (13/21) delle madri hanno un portatore retto-vaginale rispettivamente di ≥ 1 MDR-GNB e ESBL-GNB, principalmente MDR-E. coli (76%, 16/21) e MDR-K. pneumoniae (24%, 5/21). Delle 21 diadi neonato-madre, solo una ha isolati geneticamente identici (E. coli ST131 e K. pneumoniae ST3476).

I neonati gambiani ospedalizzati mostrano un'elevata prevalenza di portatori di MDR ed ESBL-GNB con acquisizione tra la nascita e il 7° giorno con prove limitate a sostegno della trasmissione da madre a neonato. Sono necessari studi genomici in contesti simili per comprendere meglio la trasmissione e informare le politiche mirate di sorveglianza e prevenzione delle infezioni.

I batteri resistenti a più antibiotici sono un’importante causa di infezione e morte dei neonati nei paesi a basse risorse, in particolare dei bambini piccoli o prematuri nati in ambienti ospedalieri. Non è noto come questi batteri resistenti vengano acquisiti sulla pelle e nell’intestino dei neonati, in particolare se siano comunemente trasferiti dalla madre. Abbiamo studiato i batteri presenti nei piccoli neonati gambiani e nelle loro madri per comprendere il tipo di batteri, il livello di resistenza agli antibiotici, il numero di neonati e madri colpiti e la somiglianza di questi batteri tra i neonati e le loro madri. Abbiamo scoperto che, nonostante molti neonati siano portatori di questi batteri, questi sono diversi da quelli presenti nelle madri. Ciò suggerisce che i batteri vengono acquisiti dall’ambiente ospedaliero. Il nostro studio evidenzia l’importanza di sviluppare strategie per identificare e ridurre la presenza di tali batteri negli ospedali per ridurne l’acquisizione da parte dei neonati ospedalizzati vulnerabili.

La mortalità neonatale rimane inaccettabilmente elevata in molti paesi africani e asiatici, rappresentando il 47% dei decessi tra i bambini sotto i 5 anni1. Le infezioni invasive contribuiscono in modo importante alle morti neonatali, con un impatto elevato in Africa e un elevato rischio relativo di mortalità2,3. I piccoli neonati vulnerabili nati prematuri (< 37 settimane di gestazione) e/o con basso peso alla nascita (LBW; < 2,5 kg) sono quelli a maggior rischio di infezioni a causa della compromissione dell'immunità innata e adattativa4, della degenza ospedaliera prolungata e delle procedure invasive5. Il trasporto intestinale di agenti patogeni con traslocazione attraverso la parete intestinale è associato a infezioni a esordio tardivo e disturbi infiammatori6 e l'integrità della pelle dei neonati prematuri è generalmente compromessa, fornendo un'ulteriore via per l'infezione invasiva.

Si stima che circa il 31% delle 690.000 morti neonatali annuali associate alla sepsi siano potenzialmente attribuibili alla resistenza antimicrobica (AMR)7. Tra i batteri Gram-negativi (GNB), gli Enterobacterales sono la principale causa di gravi infezioni batteriche nei neonati africani2,8,9, con Klebsiella pneumoniae ed Escherichia coli più comunemente implicati. La resistenza multifarmaco (MDR) è riscontrata nell'82% dei casi di GNB neonatale invasivo in Africa10,11, con una prevalenza in aumento11 e sfide gestionali dovute a opzioni diagnostiche e terapeutiche limitate7. I GNB produttori di beta lattamasi a spettro esteso (ESBL) sono stati elencati come patogeni ad alta priorità per la ricerca e lo sviluppo di antibiotici dall'Organizzazione Mondiale della Sanità nel 201712 e rappresentano un'emergenza sanitaria pubblica neonatale che è fondamentale da affrontare se si raggiungono gli obiettivi globali di ridurre la mortalità neonatale. Entro il 203013 si dovrà raggiungere un obiettivo ≤12/1000 nati vivi.